您好、欢迎来到现金彩票网!
当前位置:2019全年免费资料大全 > 统计数据库 >

数据库更新不及时基因注释遗漏20%

发布时间:2019-05-20 23:10 来源:未知 编辑:admin

  在基因测序后的数据分析中,最关键的一步就是需要将差异/变异的基因(蛋白)进行基因GO功能注释/pathway通路富集分析。

  通路富集分析的结果,在很大程度上取决于你所使用数据库的深度和广度......

  目前,正在运行的DAVID 6.8版后台知识库的最后更新时间,竟然还停留在2016年5月......

  另外,常用的注释富集数据库是KOBAS 3.0,这个由国内北大生科院生物信息中心创建,最近的维护时间也是2016年8月......

  基因本体联合会 (Gene Onotology Consortium)于今年1月份就在Nucleic Acids Research撰文强调,加强基因功能注释的审查工作,新近发现有关基因功能的实验数据,将会被持续更新,并替换那些“已过时”的注释。

  官方统计,在2018年9月时,GO知识库收录的基因注释信息数量,比2016年就有了较大幅度增加。

  KEGG通路,集人工绘制分子通路为一体的图谱,代表对分子相互作用、反应和关系网络等已有知识的梳理整合。

  KEGG通路数据库,从当时v77.0版,更新到当前v90.1版。在Pathway的数量上,就已有

  学技术和研究逐步深入,在5月1日最新更新的代谢通路(metabolic pathways)中,收录同源序列和通路模块数量增加了50%。

  别折腾了!通路还是老的好,经典分子忘不了......有很多数据库和工具,都能对基因注释以及对基因列表富集分析。但能够妥善维护的数据库工具,却寥寥无几。

  对于从事基础研究和临床的科研人员,特别是那些不具备编程专业知识的生物学家来说,基因数据的注释和富集仍然有些困难。

  的更新维护使用非常简单,只要将基因列表粘贴提交,将自动识别各种基因或蛋白质的标识符。

  蛋白质网络文件格式还支持用第三方软件比如Cytoscape进行更加深入的分析。用户熟悉后,也可以使用Custom Analysis按钮对更多的分析功能和参数予以调节。

http://linkzoo.net/tongjishujuku/31.html
锟斤拷锟斤拷锟斤拷QQ微锟斤拷锟斤拷锟斤拷锟斤拷锟斤拷锟斤拷微锟斤拷
关于我们|联系我们|版权声明|网站地图|
Copyright © 2002-2019 现金彩票 版权所有